Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnhQ61458 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms