Protein–RNA interactions for Protein: Q61268

Apoc4, Apolipoprotein C-IV, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc4Q61268 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms