Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp7Q60973 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp7Q60973 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp7Q60973 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp7Q60973 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp7Q60973 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp7Q60973 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp7Q60973 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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