Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nr2f1Q60632 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nr2f1Q60632 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms