Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms