Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms