Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms