Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms