Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa20Q45VN2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms