Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms