Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms