Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trim80Q3V061 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim80Q3V061 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim80Q3V061 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim80Q3V061 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim80Q3V061 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim80Q3V061 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim80Q3V061 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim80Q3V061 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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