Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms