Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms