Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elf3Q3UPW2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms