Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms