Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms