Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp30Q3UN04 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp30Q3UN04 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp30Q3UN04 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp30Q3UN04 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp30Q3UN04 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp30Q3UN04 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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