Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod2Q3UHZ5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod2Q3UHZ5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms