Protein–RNA interactions for Protein: Q3UCV8

Otulin, Ubiquitin thioesterase otulin, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtulinQ3UCV8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtulinQ3UCV8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtulinQ3UCV8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms