Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms