Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc9Q3U0M1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms