Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms