Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms