Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms