Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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