Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc39dQ0VF76 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc39dQ0VF76 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc39dQ0VF76 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc39dQ0VF76 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc39dQ0VF76 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc39dQ0VF76 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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