Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc3h18Q0P678 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms