Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps8Q0P5W1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms