Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms