Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms