Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox9Q04887 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms