Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Top1Q04750 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms