Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pfdn6Q03958 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pfdn6Q03958 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pfdn6Q03958 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pfdn6Q03958 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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