Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms