Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms