Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Thbs2Q03350 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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