Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
AsipQ03288 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms