Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp39Q02525 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp39Q02525 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms