Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms