Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms