Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms