Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms