Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfbiP82198 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfbiP82198 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms