Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx3P70354 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms