Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf6P70279 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf6P70279 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms