Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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