Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snap25P60879 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms