Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms