Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csrnp1P59054 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrnp1P59054 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms